个人简介

田侦，男，副教授，硕士生导师，中国计算机学会生物信息学专委会委员。2017年11月毕业于哈尔滨工业大学，获得计算机科学与技术专业博士学位。2018年3月至今在郑州大学计算机与人工智能学院软件工程系任教。主要讲授《微机原理及接口技术》《算法设计与分析》等课程，主要研究方向机器学习，数据挖掘和生物信息学。目前主持（完成）国家自然科学基金一项，河南省博士后基金一项，河南省科技攻关项目一项。目前已在Briefings in Bioinformatics, BMC Bioinformatics，Expert Systems with Applications ,TCBB, BMC Systems Biology和BIBM2020等学术期刊和会议上发表多篇论文，多次担任Briefings in Bioinformatics, TCBB和BIBM等期刊和会议审稿人，详情请见 Google Scholar 。

教育与工作经历

• 2023年01月至今，郑州大学，计算机与人工智能学院，软件工程系，副教授
• 2020年01月-2022年12月，郑州大学，计算机与人工智能学院，副教授（直聘）
• 2020年01月-2021年02月，美国俄亥俄州立大学（Ohio State University）访问学者
• 2018年03月-2020年01月，郑州大学，信息工程学院，软件工程系，讲师
• 2013.09-2017.11：博士，哈尔滨工业大学，计算机科学与技术专业（导师：郭茂祖）
• 2011.09-2013.07：硕士，哈尔滨工业大学，计算机科学与技术专业
• 2007.09-2011.07：学士，哈尔滨工程大学，计算机科学与技术专业

研究方向

• 基因本体及基因功能相似度计算
• 基于深度学习模型的生物实体关系预测
• 致病基因挖掘方法
• 知识图谱表示学习

科研项目

（一）主持科研项目

• [1] 国家自然科学基金委员会，面上项目，62371423，知识图谱增强的跨视角分层图对比学习方法研究，2024.01至2027.12，53万元，在研，主持
• [2] 国家自然科学基金委员会，青年科学基金项目，61801432，基于多元数据融合的药物重定位方法研究，2019.01至2021.12，24万元，结题，主持
• [3] 河南省博士后基金面上项目，202002014，基于多元数据融合的药物-子通路关联关系预测，结题,主持
• [4] 河南省科技攻关，232102211027，基于分层注意力机制的药物靶标关系预测研究，在研，主持

（二）参与科研项目

• [1] 国家自然科学基金委员会，面上项目，61671189，侯选药物筛选中分子对接及药靶网络构建方法，结题，参与
• [2] 国家自然科学基金委员会，重点项目，61532014，基于网络模型的癌症相关模式挖掘理论与方法，结题，参与
• [3] 国家自然科学基金委员会，面上项目，61402132，基于高通量测序数据多供体植物基因组结构变异识别方法研究，结题，参与

发表期刊论文列表

（一）第一作者/通讯作者（*）

• Zhen Tian^# , Chenguang Han^#（指导学生）, Xu Lewen, Song Wei ^* . MGCNSS: miRNA–disease association prediction with multi-layer graph convolution and distance-based negative sample selection strategy[J]. Briefings in Bioinformatics, 2024, 25(3): bbae168.

• Zhixia Teng, Linyue Shi, Haihao Yu, Chengyan Wu, Zhen Tian^* . Measuring functional similarity of lncRNAs based on variable K-mer profiles of nucleotide sequences[J]. Methods, 2023, 212: 21-30.

• Zhen Tian, Yue Yu, Haichuan Fang, Weixin Xie, Maozu Guo^*. Predicting microbe–drug associations with structure-enhanced contrastive learning and self-paced negative sampling strategy[J]. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(2): bbac634.

• Zhen Tian^#,*, Xiangyu Peng^#（指导学生）, Haichuan Fang, Wenjie Zhang, Qiguo Dai, Yangdong Ye^*. MHADTI: predicting drug–target interactions via multiview heterogeneous information network embedding with hierarchical attention mechanisms[J]. Briefings in Bioinformatics, 2022, 23(6): bbac434.
• Zhengzheng Lou, Zhaoxu Cheng, Hui Li, Zhixia Teng, Yang Liu, Zhen Tian^*. Predicting miRNA–disease associations via learning multimodal networks and fusing mixed neighborhood information[J]. Briefings in Bioinformatics, 2022.
• Zhen Tian^#, Haichuan Fang^#（指导学生）, Zhixia Teng, Yangdong Ye^*. GOGCN: Graph Convolutional Network on Gene Ontology for Functional Similarity Analysis of Genes. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2022.
• Haichuan Fang（指导学生）, Youwei Wang, Zhen Tian^*, Yangdong Ye^*. Learning knowledge graph embedding with a dual-attention embedding network[J]. Expert Systems with Applications, 2023, 212: 118806.
• Zhen Tian, Haichuan Fang, Yangdong Ye, Zhenfeng Zhu^*. A novel gene functional similarity calculation model by utilizing the specificity of terms and relationships in gene ontology[J]. BMC bioinformatics, 2022, 23(1): 1-14.
• Zhen Tian, Zhixia Teng, Shuang Cheng, Maozu Guo^*. Computational drug repositioning using meta-path-based semantic network analysis. BMC Systems Biology, 2018, 12(9): 123-134.
• Zhen Tian, Haichuan Fang, Yangdong Ye, Zhenfeng Zhu^*. SWE: a novel method with semantic-weighted edge for measuring gene functional similarity[C]. 2020 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). IEEE, 2020: 1672-1678.
• Zhen Tian, Maozu Guo^*, Chunyu Wang, Xiaoyan Liu, Shiming Wang. Tian Z, Guo M, Wang C, et al. Refine gene functional similarity network based on interaction networks[J]. BMC bioinformatics, 2017, 18(16): 183-193.
• Zhen Tian, Maozu Guo^*, Chunyu Wang, LinLin Xing, Lei Wang, Yin Zhang. Constructing an integrated gene similarity network for the identification of disease genes[J]. Journal of biomedical semantics, 2017, 8(1): 27-41.
• Zhen Tian, Chunyu Wang, Maozu Guo^*, Xiaoyan Liu, Zhixia Teng. An improved method for functional similarity analysis of genes based on Gene Ontology[J]. BMC systems biology, 2016, 10(4): 465-484.
• Zhen Tian, Chunyu Wang, Maozu Guo^*, Xiaoyan Liu, Zhixia Teng. SGFSC: speeding the gene functional similarity calculation based on hash tables[J]. BMC bioinformatics, 2016, 17(1): 1-14.
• 朱真峰, 田侦^*. 基于思维导图的数据库原理课程总体认知分析[J]. 计算机教育, 2020.

（二）共同作者

• 郭茂祖, 王诗鸣, 刘晓燕，田侦 . miRNA 与疾病关联关系预测算法[J]. 软件学报, 2017, 28(11): 3094-3102.
• Zhixia Teng, Maozu Guo, Xiaoyan Liu, Zhen Tian, Kai Che. Revealing protein functions based on relationships of interacting proteins and GO terms[J]. Journal of -biomedical semantics, 2017, 8(1): 9-17.
• Zhixia Teng, Zhengnan Zhao, Yanjuan Li, Zhen Tian, Maozu Guo, Qianzi Lu, Guohua Wang i6mA-Vote: cross-species identification of DNA N6-methyladenine sites in plant genomes based on ensemble learning with voting[J]. Frontiers in Plant Science, 2022, 13.
• Zhixia Teng, Zitong Zhang, Zhen Tian, Yanjuan Li, Guohua Wang. ReRF-Pred: predicting amyloidogenic regions of proteins based on their pseudo amino acid composition and tripeptide composition[J]. BMC bioinformatics, 2021, 22: 1-18.
• Qiguo Dai, Zhaowei Wang, Jinmiao Song, Xiaodong Duan, Maozu Guo, Zhen Tian. A stacked ensemble learning framework with heterogeneous feature combinations for predicting ncRNA-protein interaction[C]//2020 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). IEEE, 2020: 67-71.
• Xiao Yang, Zhen Tian, Huayang Cui, Zhaoxin Zhang[C]. Link prediction on evolving network using tensor-based node similarity. 2012 IEEE 2nd International Conference on Cloud Computing and Intelligence Systems. IEEE, 2012, 1: 154-158.

培养学生

• 方海川（Haichuan Fang）2019级硕士，郑州大学计算机学院读博
• 彭祥余（Xiangyu Peng）2020级硕士，商丘学院工作
• 余 跃（Yue Yu）2021级硕士，哈尔滨工业大学读博，国家奖学金获得者
• 韩晨光（Chenguang Han）2021级硕士
• 徐乐文（Lewen Xu）2021级硕士
• 罗贤臣（Xianchen Luo）2022级硕士
• 张壮壮（Zhuangzhuang Zhang）2022级硕士
• 周婉宁（Wanning Zhou）2022级硕士
• 朱赛赛（SaiSai Zhu）2023级硕士
• 林梦翔（Mengxiang Lin）2023级硕士
• 范荣琪（Rongqi Fan）2023级硕士
• 蒋淼（Miao Jiang）2024级硕士
• 张浩然（Haoran Zhang）2024级硕士

联系方式

• 电子邮箱：ieztian（AT）zzu.edu.cn && zhentian_hit（AT）163.com
• 个人主页：http://www7.zzu.edu.cn/csai/info/1054/1397.htm
• 谷歌学术：https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=6Eni8IgAAAAJ&view_op=list_works
• 联系地址：河南省郑州市科学大道100号，郑州大学计算机与人工智能学院，3313室
• 欢迎对机器学习、数据挖掘和生物信息处理等方向感兴趣的同学加入学习小组，并将个人简历和本科成绩单发送至联系邮箱。